Dù sở hữu nhiều ưu điểm vượt trội, việc vận hành và bảo mật hệ thống M142 HIMARS cũng đặt ra những thách thức không nhỏ dành cho các lực lượng quân sự hiện nay. Thách thức đầu tiên liên quan đến việc bảo đảm an toàn thông tin liên lạc và điều khiển từ xa trong môi trường chiến tranh điện tử ngày càng phức tạp và khốc liệt. Đối thủ có thể sử dụng các biện pháp gây nhiễu sóng, phá hủy dữ liệu định vị hoặc tấn công mạng nhằm làm gián đoạn quy trình phóng và dẫn đường tên lửa. Do vậy, việc xây dựng các lớp bảo mật, khả năng chống nhiễu hiệu quả luôn là ưu tiên cao trong vận hành M142 HIMARS. Bên cạnh đó, đội ngũ vận hành phải được chuẩn bị kỹ lưỡng để xử lý các tình huống khẩn cấp khi thông tin mất liên lạc hoặc hệ thống điện tử có dấu hiệu lỗi. Thách thức tiếp theo nằm ở việc duy trì hoạt động liên tục trong điều kiện khí hậu khắc nghiệt hoặc vùng chiến sự phức tạp khi mà các thiết bị điện tử nhạy cảm dễ gặp trục trặc. Kiến thức chuyên sâu về cấu tạo và quy trình bảo dưỡng được đánh giá là cần thiết để ngăn ngừa hiện tượng hỏng hóc trong những thời điểm quyết định. Mặc dù vậy, với việc không ngừng nâng cấp phần mềm và cải tiến thiết bị, các lực lượng sử dụng M142 HIMARS đang dần xây dựng được môi trường vận hành ổn định và an toàn hơn trong thực chiến. HIMARS carries a single six-pack of GMLRS rockets or one TACMS missile on the Army's Family of Medium Tactical Vehicles (FMTV) 5-ton truck, and can launch the entire MLRS family of munitions. Việc phát huy ưu thế của M142 HIMARS không thể tách rời khỏi sự đa dạng và tính chuyên biệt của các loại đạn mà hệ thống có thể sử dụng. Mỗi loại đạn đều được thiết kế phù hợp với từng kịch bản tác chiến nhằm tận dụng tối đa sức mạnh tấn công và hiệu quả tiêu diệt mục tiêu. Loại đạn phổ biến nhất trên HIMARS là GMLRS – quả rocket dẫn đường chính xác, có tầm bay lên đến 70 km, thích hợp cho việc phá hủy các mục tiêu quan trọng như bệ pháo, căn cứ quân địch hoặc kho đạn. Đạn này với các đầu nổ hiện đại có khả năng tung mảnh và nổ diện rộng, gây sát thương lớn trên một khu vực mục tiêu. Ngoài ra, HIMARS còn có thể phóng tên lửa ATACMS (Army Tactical Missile System) với tầm bắn vượt trội lên đến hơn 300 km, phù hợp cho các vụ tấn công sâu nhằm mục tiêu chiến lược. Trong các trường hợp cần tấn công địch có lực lượng đông hoặc trang bị hỏa lực mạnh, HIMARS có thể phối hợp sử dụng các loại đạn tầm ngắn hoặc rocket không điều khiển để tạo sát thương diện rộng nhanh chóng. Tính năng tùy biến trong việc nạp đạn giúp đội vận hành có thể linh hoạt lựa chọn đạn phù hợp với mục đích và địch tình, từ đó giúp nâng cao hiệu quả chiến đấu cũng như tối ưu hóa chi phí sử dụng trong thực địa. Theo đó, Chính phủ Cộng hòa Latvia đã đề nghị mua 6 hệ thống pháo phản lực M142 HIMARS , 12 đầu đạn thay thế của rocket M30A2 GMLRS, 12 rocket M31A2 GMLRS-U và 10 hệ thống tên lửa chiến thuật ATACMS, cùng nhiều thiết bị, đạn được, phụ tùng khác.
